レポートで文字数制限がある場合名前や学修番号、参考文献などは含まれますか？
またkibacoでのテキストボックスで提出の場合改行したスペースの部分もカウントされてしまい、文字数が超えてしまうのですが打った文字だけで数えてしまって良いのでしょうか？

授業でレポートの書き方に言及があると思います。特に指定がなければ本文のみを字数としてカウントするのが一般的です。参考文献からの引用は本文の字数としてカウントしますが、引用元の記載や注をページ下部で行う場合（ https://omu.repo.nii.ac.jp/record/7143/files/2012000184.pdf これとかわかりやすい）字数としてカウントしないことが多いです。ぶっちゃけ先生に聞くのが一番いいです。
kibacoのテキストボックスでの提出は、（これ書いている人の環境だと）Enter改行を15文字、Shift+Enter改行を13文字として扱っているようです。なんなら最初の一文字を9文字分として扱っています。どちらにせよ正確ではないので、kibacoのテキストボックスが言う文字数は気にしなくていいと思います。