キャンパススクエアで登録されていない授業をkibacoで自己登録すると何か不都合はありますか？
現在、潜る際の資料閲覧を目的に登録したままにしている授業と、一週目を経て切ることにしたのに登録解除のチェックができなくなってしまった授業が登録された状態になっており、勝手にキャンパススクエアに再登録などされないか不安です。

結論から申し上げますと、CampusSquareで履修登録していない授業をkibacoで自己登録していても、特にこれといって弊害はありません。kibacoでどんなに成績がついても、どうせ履修していないのでその科目の単位は取れませんし、そのようなことをしても特に咎められることはありません。

追記(2025/4/21)
勝手にCampusSquareに再登録された、という事案は去年までなかったので大丈夫だと思います。
これを書いている人は毎年いくつか潜っている授業があり、kibacoだけ登録してCampusSquareは履修登録していない、という状態ですが、特にお咎めもなく、CampusSquareに勝手に登録されるということもなかったので、ご安心ください。